Obowiązujące przepisy prawa wyraźnie określają zasady odpowiedniego gospodarowania odpadami farmaceutycznymi, z uwagi na kwestie bezpieczeństwa, zdrowie oraz życie ludzi i ochronę środowiska naturalnego.

Dużym problemem wszystkich zakładów produkcyjnych, w tym również zakładów farmaceutycznych, są powstające podczas procesu produkcji odpady oraz substancje w procesie ich produkcji. Dodatkowym utrudnieniem dla tej branży jest fakt, iż bardzo często są to odpady szkodliwe. Odpady, których nie można ponownie wykorzystać są unieszkodliwiane w odpowiednich dla nich warunkach i procesach.